Es el conjunto de las áreas protegidas privadas, comunitarias y públicas, del ámbito de gestión local, regional y nacional, los actores sociales e institucionales, los arreglos de gobernanza e instrumentos de gestión que, articulados entre sí, son necesarios para su conservación. El SINAP junto con otras estrategias, contribuyen al cumplimiento de los objetivos de conservación del país. Una de las funciones de Corpoboyacá con respecto a las metas del SINAP, es la identificación de la Estructura Ecológica Principal de la jurisdicción y la declaración de áreas protegidas en cumplimiento de los objetivos nacionales y regionales para la conservación de las áreas de importancia ecosistémica.